Sinopse: Três anos se passaram após a derrota de Naga e a reconstrução de Vestróia, que agora passou a se chamar Nova Vestróia. Dan e Runo estão namorando, enquanto Marucho e Julie vivem espiando seus encontros. Shun voltou a morar com seu avô, assim como Alice. Contudo, nesse tempo surgiu em Nova Vestróia uma raça alienígena com aparência humana, os Vestais. Eles tomaram a Nova Vestróia e controlaram os Bakugans pensando que eles era somente animais e passaram a usá-los para seu divertimento pessoal.
